森羅殿現有建築改建時至1993年 (民82) ,由於1945年戰後重建倉卒,並未特別選材,海清宮建築主體建築歷經近五十載之風霜,樑柱腐朽,牆壁斑剝,乃興擴大重建之計劃,經擇定於是年農曆五月八日午時舉行奠基破土典禮,前殿改建期間,閻羅天子神駕寄殿於後殿一樓地藏王菩薩正前方,建築之內容包含:三川殿、主殿、鐘樓、鼓樓、福德正神殿、註生娘娘殿及接待室與事務所,全數採頂級非洲花梨木、青斗石及花崗石為主要構架,木材經過精細雕琢後,採傳統建築榫接工法組合及彩繪,主殿森羅殿之神龕更是以稀有的原生台灣檜木雕製組裝而成,工程於2007年 (民96) 農曆十一月廿一日子時完成最後福德正神殿及註生娘娘殿之上樑典禮後,終於進入工程收尾階段。
此重建工程,由於作工繁瑣耗時,包含木材雕刻備料,工期歷經十六年,總經費超過新台幣十五億元,終於2009年 (民98) 秋全數完工,並於2009年 (民98) 十月初八日子時安座,同時舉辦海清宮立廟272年首次醮典『2009己丑年三條崙海清宮閰羅天子包公祖廟擴建森羅殿慶成入火安座大典啟建祈安護國禮斗五朝清醮』。
建築所用之材料,為遠赴南非購買之一百二十萬才木材,運回台灣彫刻,及到中國採購約二百個大貨櫃體積的石材。
建築 (包含正殿、三川殿、配殿、鐘鼓樓及接待室與事務所閣樓) 採傳統閩南式建築風格,特色如下:
一. 全數採用木材、原石為主要架構,並採傳統工法榫接,不用一釘。
二. 建築規模加深、加高、加寬,三川殿、大殿總坪數近八百坪。
三. 三川殿擴建為九開間,設有七門,立面為三重簷垂形,高24公尺。
四. 森羅殿擴建為五開間三重簷歇山式建築,總高度27公尺(約七、八層樓高)。
五. 森羅殿之十六支木造點金柱,最高達16公尺,木結構之規模為全國之冠,世界亦稀有。
六. 森羅殿之八卦藻井,層疊而上,井然有序,巧奪天工.
七. 由台南及北港匠師操刀,運用大量雕刻及傳統彩繪,其量與質,均值得細細品味觀賞,
八. 森羅殿神龕由原生台灣檜木雕製並貼純金金箔。